10月17日，马英九提出了与大陆洽签“和平协议”。随后又推出了“国家需要”、“民意支持”、“国会监督”的三项前提。最近在接受采访时，马英九又提出如果连任，“绝对不会在未来的四年当中跟大陆的领导人见面，绝对不会跟大陆去谈统一的问题”。马英九连番的表态和言论不仅引发了台湾内部的高度争议，也在两岸间造成了广泛的讨论。
对此，朱新民在接受中评社记者采访时说，不谈统一不代表不谈和平，这两个概念是有区别的。和平协议是去讨论如何制度化、稳定化两岸之间的和平状态。统一是和平协议未来的可能性选择，不谈统一不代表不要和平。
他认为，尽管马英九因为提出和平协议而遭到了不少的批评，但不可否认的是马英九让和平协议的应该是在台湾内部经历过一次有深度有意义有质疑的辩论或讨论，台湾的人民与各政治人物其实都心知肚明，两岸关系在经历了经贸、文化、社会各层面的协议这后，最终无可回避的要去面对两岸政治性议题这协商谈判。台湾方面能够有更多的心理建设，有更充分的事前准备，有更高的内部共识，就不会陷入自相矛盾与自乱阵脚的困扰。
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